Struktura organizacyjna przedstawiona w systemie elektronicznego obiegu dokumentów SIDAS oparta jest na strukturze drzewa. Aby urzeczywistnić najprostszy obieg w systemie muszą istnieć w strukturze odpowiednie grupy, w których znajdą się osoby zajmujące określone pozycje występujące w tych komórkach (dla najistotniejszych stanowisk np. kierownik komórki czy sekretariat, są zdefiniowane w systemie odpowiednie grupy uprawnień). Nazwy stanowisk oraz komórek organizacyjnych mogą być tworzone dowolnie i dostosowywane podczas wdrożenia system do nazewnictwa obowiązującego w danej jednostce w związku z czym, nie muszą być dokładnie takie same jak przedstawione poniżej i w aplikacji każdego klienta mogą się różnić